基于fMRI数据计算脑脊液(CSF)与全脑BOLD信号的时间耦合分析
一、前言笔者之前的文章《基于Dpabi和spm12的脑脊液（csf）分割和提取笔记》，介绍了怎样从普通的fMRI数据中提取CSF信号。起首是底子的预处理，包括时间层校正、头动校正，再加上0.01-0.1Hz的带通滤波。接着用SPM12分割出CSF地区，设置一个比较严格的0.9阈值，确保提取的真是CSF信号。末了在桥前池谁人位置，也就是末了一个非零层面上把CSF信号提取出来。
本笔记打算更进一步，研究CSF信号和全脑BOLD信号之间的关系。这种耦合关系其实挺故意思：它大概反映出大脑的代谢清除效率，也大概和神经胶质淋巴系统的功能有关。笔者会具体介绍怎样计算这个耦合度，把整个分析流程和相关代码都分享出来。希望能和同样对这个方向感兴趣的同学一起交流。
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二、数学原理-互相关(Cross-correlation)
一、耦合度定义
互相关(Cross-correlation)是丈量两个信号相似度的简朴方法，用它来度量BOLD-CSF的耦合可以告诉我们:
[*]BOLD和CSF信号有多相似
[*]CSF信号要延迟多少时间才能最匹配BOLD信号
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