生物信息Rust-01
前言-为什么想学Rust？不停想多学一门编译语言，重要有几个原因吧（1. 看到一位老师实验室要求需要把握一门编译语言；2. 本身享想试着开发一些实用的生信工具，感觉本身现在相比于数据分析，探索生物学层面的意义相比更想做一些实用性的东西出来），之前在C、C++、Rust之间摇摆，不停没有举措起来学，确实也怪本身拖延。
直到前段时间，想去的那个实验室发了一篇很有创新性的文章，又勾起了我想前去深造的想法。（叠个甲，不是只想着为了发文章才去，而是以为在那里会有更多的大概性。）再浏览实验室信息的时候，偶然发现一位博士师兄之前竟然是我在B-G-I实习时候的室友，只管只当了三四天的室友，但对他的一些基本情况照旧比较了解的。知道他去了那个学校，但没想到竟然去了那位老师门下。
有在网上搜索这位师兄的相干信息，确实很精良，把握许多技能，渐渐地内心将他变成了我研究生阶段的榜样。看到他的github大概是推文中都在推荐Rust，我那摇摆的天平最终方向Rust这边，下决心要开始举措了。
再不做真的就wan（晚/完）了。
说干就干，赶紧学！！！
PS：现在脑中有个小工具的雏形，夺取能在本年实现！！
Rust资源
[*]Rust圣经
关于本书 - Rust语言圣经(Rust Course)
[*]菜鸟教程
Rust 教程 | 菜鸟教程
[*]Rust官方文档中文教程
Rust 文档网 - Rust 官方文档中文教程
[*]rustlings
https://github.com/rust-lang/rustlings/
[*]在线运行网站
Rust Playground
[*]Rust By Example
Introduction - Rust By Example
Rust特点
简单了解一下Rust特点，之前不停听说一大特点是内存安全，之前在大一时候学过C++，但是到后面学指针的时候就开小差了，其实也不能很好理解这部门内容。这里引用一下菜鸟教程里的内容吧：
[*]内存安全：Rust 的所有权体系在编译时防止空悬指针、数据竞争等内存错误，无需垃圾网络器。
[*]并发编程：Rust 提供了现代的语言特性来支持并发编程，如线程和消息传递，使得编写并发程序更加安全和容易。
[*]性能：Rust 编译为机器码，没有运行时或垃圾网络器，能够提供靠近 C 和 C++ 的性能。
[*]范例体系：Rust 的范例体系和模式匹配提供了强盛的抽象能力，有助于编写更安全、更可预测的代码。
[*]错误处理：Rust 的错误处理模型鼓励显式处理所有大概的错误情况。
[*]宏体系：Rust 提供了一个强盛的宏体系，答应开发者在编译时编写和重用代码。
[*]包管理：Rust 的包管理器 Cargo 简化了依赖管理和构建过程。
[*]跨平台：Rust 支持多种操纵体系和平台，包括 Windows、macOS、Linux、BSDs 等。
[*]社区支持：Rust 有一个活泼的社区，提供了大量的库和工具。
[*]工具链：Rust 拥有丰富的工具链，包括编译器、包管理器、文档天生器等。
[*]无段错误：Rust 的所有权和生命周期规则保证了引用的有效性，从而制止了段错误。
[*]迭代器和闭包：Rust 提供了强盛的迭代器和闭包支持，简化了聚集的处理。
对于生信可以借助Rust举行工具开发，这也是我不停想学着做的一件事
Cargo
我们在平常管理生信环境是经常会用到conda/pip，那么在Rust里面可以使用Cargo来对包举行管理。
创建项目
在这里使用cargo创建一个world_hello项目
(base) PS D:\000zyf\Learning\rust_learn> cargo new world_hello
Creating binary (application) `world_hello` package
note: see more `Cargo.toml` keys and their definitions at https://doc.rust-lang.org/cargo/reference/manifest.html
(base) PS D:\000zyf\Learning\rust_learn> cd .\world_hello\
(base) PS D:\000zyf\Learning\rust_learn\world_hello> ls
Directory: D:\000zyf\Learning\rust_learn\world_hello
Mode LastWriteTime Length Name
---- ------------- ------ ----
d---- 2025/4/12 21:33 src
-a--- 2025/4/12 21:33 82 Cargo.toml
(base) PS D:\000zyf\Learning\rust_learn\world_hello> 这里假如使用下令cargo new --vcs git xxx来创建项目标话还会给出相应的git文件。
吐槽：windows终端上操纵真难受！！
运行项目
有两种方式运行：
[*]cargo run
[*]手动编译和运行项目
cargo run
在刚刚创建的项目路径下运行cargo run便可看到：
(base) PS D:\000zyf\Learning\rust_learn\world_hello> cargo run
Compiling world_hello v0.1.0 (D:\000zyf\Learning\rust_learn\world_hello)
Finished `dev` profile target(s) in 5.83s
Running `target\debug\world_hello.exe`
Hello, world! 上述代码，cargo run 起首对项目举行编译，然后再运行，因此它现实上等同于运行了两个指令
手动编译运行
(base) PS D:\000zyf\Learning\rust_learn\world_hello> cargo build
Finished `dev` profile target(s) in 0.03s
(base) PS D:\000zyf\Learning\rust_learn\world_hello> ls
Directory: D:\000zyf\Learning\rust_learn\world_hello
Mode LastWriteTime Length Name
---- ------------- ------ ----
d---- 2025/4/12 21:39 src
d---- 2025/4/12 21:50 target
-a--- 2025/4/12 21:39 8 .gitignore
-a--- 2025/4/12 21:50 155 Cargo.lock
-a--- 2025/4/12 21:39 82 Cargo.toml
(base) PS D:\000zyf\Learning\rust_learn\world_hello> .\target\debug\world_hello.exe
Hello, world!
(base) PS D:\000zyf\Learning\rust_learn\world_hello> 行云流水，但谈不上趁热打铁。 细心的读者大概已经发现，在调用的时候，路径 ./target/debug/world_hello 中有一个明晃晃的 debug 字段，没错我们运行的是 debug 模式，在这种模式下，代码的编译速率会非常快，但是福兮祸所伏，运行速率就慢了. 原因是，在 debug 模式下，Rust 编译器不会做任何的优化，只为了尽快的编译完成，让你的开发流程更加顺畅。
好比你想要高性能的代码怎么办？ 简单，添加 --release 来编译：
cargo run --release
cargo build --release
试着运行一下我们高性能的 release 程序：
(base) PS D:\000zyf\Learning\rust_learn\world_hello> cd .\target\
(base) PS D:\000zyf\Learning\rust_learn\world_hello\target> ls
Directory: D:\000zyf\Learning\rust_learn\world_hello\target
Mode LastWriteTime Length Name
---- ------------- ------ ----
d---- 2025/4/12 21:51 debug
d---- 2025/4/12 22:00 release
-a--- 2025/4/12 21:51 1120 .rustc_info.json
-a--- 2025/4/12 21:50 177 CACHEDIR.TAG
(base) PS D:\000zyf\Learning\rust_learn\world_hello\target> .\release\world_hello.exe
Hello, world! cargo check
当项目大了后，cargo run 和 cargo build 不可制止的会变慢，那么有没有更快的方式来验证代码的精确性呢？大杀器来了，接着！
cargo check 是我们在代码开发过程中最常用的下令，它的作用很简单：快速的查抄一下代码能否编译通过。因此该下令速率会非常快，能节省大量的编译时间。
Cargo.toml和Cargo.lock
Cargo.toml 和 Cargo.lock 是 cargo 的核心文件，它的所有运动均基于此二者。
Cargo.toml 是 cargo 特有的项目数据描述文件。它存储了项目标所有元配置信息，假如 Rust 开发者希望 Rust 项目能够按照期望的方式举行构建、测试和运行，那么，必须按照合理的方式构建 Cargo.toml。
Cargo.lock 文件是 cargo 工具根据同一项目标 toml 文件天生的项目依赖具体清单，因此我们一般不用修改它。
什么情况下该把 Cargo.lock 上传到 git 仓库里？很简单，当你的项目是一个可运行的程序时，就上传 Cargo.lock，假如是一个依赖库项目，那么请把它添加到 .gitignore 中。
现在用 VSCode 打开上面创建的"天下，你好"项目，然后进入根目录的 Cargo.toml 文件，可以看到该文件包含不少信息：
name = "world_hello"
version = "0.1.0"
edition = "2024"
name 字段界说了项目名称，version 字段界说当前版本，新项目默认是 0.1.0，edition 字段界说了我们使用的 Rust 大版本。
界说项目依赖
使用 cargo 工具的最大上风就在于，能够对该项目标各种依赖项举行方便、统一和灵活的管理。
在 Cargo.toml 中，重要通过各种依赖段落来描述该项目标各种依赖项：
[*]基于 Rust 官方仓库 crates.io，通过版本说明来描述
[*]基于项目源代码的 git 仓库地址，通过 URL 来描述
[*]基于当地项目标绝对路径大概相对路径，通过类 Unix 模式的路径来描述
免责声明：如果侵犯了您的权益，请联系站长，我们会及时删除侵权内容，谢谢合作！更多信息从访问主页：qidao123.com:ToB企服之家，中国第一个企服评测及商务社交产业平台。
页:
[1]