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标题:
seurat v5更新及样本整合方法
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作者:
汕尾海湾
时间:
2024-12-5 23:39
标题:
seurat v5更新及样本整合方法
目录
seurat v5的去批次方式
①pbmc单细胞数据
②Seurat V5多种去批次
进行归并分组数据
进行去批次
CCA降维
harmony降维
Analysis, visualization, and integration of Visium HD spatial datasets with Seurat • Seurat (satijalab.org)
Tools for Single Cell Genomics • Seurat (satijalab.org)
重点是:seurat v5对象转换成v4 ;seurat v4和v5相互转换-CSDN博客
1 Seurat 对象和 Assay 类发生了变革:
支持更多种类的检测和数据
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