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标题: 基于华为云图引擎GES,使用Cypher子查询进行图探索 [打印本页]

作者: 郭卫东    时间: 2023-5-10 18:08
标题: 基于华为云图引擎GES,使用Cypher子查询进行图探索
摘要:本文以华为云图引擎 GES 为例,来介绍如何使用图查询语言 Cypher 表达一些需要做数据局部遍历的场景。
本文分享自华为云社区《使用 Cypher 子查询进行图探索 -- 以华为云图引擎 GES 为例》,作者:蜉蝣与海。
在图数据库 / 图计算领域,很多查询可以使用图查询语言 Cypher、Gremlin 或者指令式 API 进行表达,如多跳过滤、全局检索以及对过滤后的结果进行聚集排序等操作。然而有些查询不是那么容易表达,常常需要对图中的一组数据去做局部遍历,例如在社交网络(人 - 人,人 - 兴趣,人 - 工作地的关联网络)场景中,常常涉及以下场景:
这些查询往往只关注图中的某个局部,对局部进行多跳查询,且局部上往往有类似下列限制:
在查询语言 Cypher 中,常常使用子查询来解决这类问题。本文会以华为云图引擎 GES 为例(图引擎版本 >=2.3.6),来介绍如何使用 Cypher 表达上述场景。
注:本文同步发布至华为云 AI Gallery,文中所有代码皆可以在AI Gallery上运行:【AI Gallery】使用Cypher子查询进行图探索 – 以华为云图引擎GES为例
阅读前准备

基础知识

阅读前需要了解如下基础知识
下方三个小节会指导如何配置一个 GES 实例并使用 notebook 连接 GES 服务进而做查询演示。如果你只想了解如何编写查询语句,对输入的 Cypher 查询获取返回结果没有需求,可以直接跳过下方三个小节。
本文使用的数据集

本教程使用 LDBC-SF0.1 社交数据集中截选的人物关系数据集,数据集可以从此处下载。下载后需要在 GES 中创建图并导入数据集,详细指导流程可参见华为图引擎文档 - 快速入门和华为云图引擎服务 GES 实战 —— 创图。
如何调用 GES 的 Cypher API

GES 官网帮助文档上有 GES Cypher 的 API,为了方便用户调用,API 设计为基于 http/https 请求,响应体的设计也兼容的 neo4j 的 json 格式。这里放置一下链接执行 Cypher 查询。调用 API 时需要将 Token 输入请求头中进行鉴权,有关 Token 的获取问题请参考业务面 API 认证鉴权。
本文会使用 ges4jupyter 工具脚本进行相关查询的演示,该脚本中封装了刚刚提到的鉴权 & Cypher 查询 API,并对结果进行了一些处理,提供了相关可视化的能力。
本文使用的代码包

ges4jupyter 是 jupyter 连接 GES 服务的工具文件。文件中封装了使用 GES 查询的预置条件,包括配置相关参数和对所调用 API 接口的封装,如果你对这些不感兴趣,可直接运行而不需要了解细节,这对理解后续具体查询没有影响。本文的所有语句请求都会访问一个 GES 实例并得到实际的响应。
  1. import moxing as mox
  2. mox.file.copy('obs://obs-aigallery-zc/GES/ges4jupyter/beta/ges4jupyter.py', 'ges4jupyter.py')
  3. mox.file.copy('obs://obs-aigallery-zc/GES/ges4jupyter/beta/ges4jupyter.html', 'ges4jupyter.html')
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GESConfig 的参数都是与调用 GES 服务有关的参数,依次为 “公网访问地址”、“项目 ID”、“图名”、“终端节点”、“IAM 用户名”、“IAM 用户密码”、“IAM 用户所属账户名”、“所属项目”,其获取方式可参考调用 GES 服务业务面 API 相关参数的获取。这里通过 read_csv_config 方法从配置文件中读取这些信息。如果没有配置文件,可以根据自己的需要补充下列字段。对于开启了 https 安全模式的图实例,参数 port 的值为 443。
  1. from ges4jupyter import GESConfig, GES4Jupyter, read_csv_config
  2. eip = ''
  3. project_id = ''
  4. graph_name = ''
  5. iam_url = ''
  6. user_name = ''
  7. password = ''
  8. domain_name = ''
  9. project_name = ''
  10. port = 80
  11. eip, project_id, graph_name, iam_url, user_name, password, domain_name, project_name, port = read_csv_config('cn_north_4_graph.csv')
  12. config = GESConfig(eip, project_id, graph_name,
  13. iam_url = iam_url,
  14. user_name = user_name,
  15.                     password = password,
  16. domain_name = domain_name,
  17. project_name = project_name,
  18.                     port = port)
  19. ges_util = GES4Jupyter(config, True);
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首先在 GES 中创建索引,这有利于后续查询加速。
  1. import time
  2. def wait_job_finish(util, job_id, max_loop):
  3. job_result = util.get_job(job_id)
  4. if 'errorCode' not in job_result:
  5. for i in range(max_loop):
  6. if job_result['status'] == 'success':
  7. break
  8. else:
  9. time.sleep(1)
  10. job_result = util.get_job(job_id)
  11. print(job_result)
  12. job_id = ges_util.build_vertex_index()
  13. wait_job_finish(ges_util, job_id, 100)
  14. job_id = ges_util.build_edge_index()
  15. wait_job_finish(ges_util, job_id, 100)
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可以使用下列语句查看 schema 信息:
  1. import time
  2. body = ges_util.generate_schema_structure()
  3. job_id = body["jobId"]
  4. print('开始构造schema结构:')
  5. wait_job_finish(ges_util, job_id, 100)
  6. print('schema结构构造完成')
  7. cypher_result = ges_util.cypher_query("call db.schema()",formats=['row','graph']);
  8. ges_util.format_cypher_result(cypher_result, candidate_title = ['description', 'name'])
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如图是本文使用的数据集的 schema,主要包括下列类型的点边:
使用子查询

一般来说,使用 Cypher 查询朋友的朋友是相对容易的,下列语句演示了如何查询顶点 p367 朋友的朋友。
  1. match (n)-[:KNOWS]->(a)-[:KNOWS]->(b) where id(n)='p367' return distinct b
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然而,使用一般的 Cypher 语义,从朋友的朋友中移除所有的朋友,表达朋友推荐场景中的 “朋友的朋友而非我的朋友” 却很困难。文章如何使用GES进行社交关系考据?—GES查询能力介绍中,描述了一种常规的查询语句的写法:
  1. match (n)-[:KNOWS]->(a) where id(n)='p367' with n, collect(a) as neighbor
  2. match (n)-[:KNOWS]->(a)-[:KNOWS]->(b)
  3. where not (b in neighbor)
  4. return b
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由于 cypher 的结果是使用行(Row)组织数据,所有的计算以 “行” 作为单元进行,如果要进行过滤,只能进行行内过滤。所以上述语句第一步,先通过 collect (a), 将 “朋友” 这个集合组织到了一行里,而后才能将 collect (a) 作为过滤条件,进行二次查询。
将子查询作为查询条件

在 GES 2.3.6 版本,实现了子查询能力,支持 Neo4j 中的 SemiApply 算子,该算子支持类似于下列语句的运行,使得查询更为简洁:
  1. match (n) where id(n)='p367'
  2. match (n)-[:KNOWS*2..2]->(b)
  3. where not (n)-[:KNOWS]->(b)
  4. return id(b) limit 10
  5. cypher_result = ges_util.cypher_query("""
  6. match (n) where id(n)='p367'
  7. match (n)-[:KNOWS*2..2]->(b) where not (n)-[:KNOWS]->(b)
  8. return id(b) limit 10""",formats=['row','graph']);
  9. ges_util.format_cypher_result(cypher_result)
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注意到这里 where 条件后面跟从的不是一个一般的条件表达式,不是大于小于这样的比较运算,在条件运算 not 后跟随了一个图模式(Graph Pattern),整个 where 条件表示 “不存在从顶点 n 连向顶点 b,且 label 为 KNOWS 的边”。这样的表达方式使得整条查询语句看起来更为简洁。 也可以使用 explain 查看其查询计划,可以看到是 AntiSemiApply 在发挥作用。这里条件查询主要包含两个算子:
这两个算子对每个左子树生成的结果,都去检查右子树是否会 / 不会产生满足条件的结果,并将右子树的结果作为过滤条件,辅助左子树的结果过滤。
通过这两个算子,即可实现简单的条件子查询。
  1. cypher_result = ges_util.cypher_query("""explain
  2. match (n) where id(n)='p367'
  3. match (n)-[:KNOWS*2..2]->(b) where not (n)-[:KNOWS]->(b)
  4. return id(b) limit 10""",formats=['row','graph']);
  5. ges_util.format_cypher_result(cypher_result)
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子查询作为条件,也可以用来描述兴趣推荐 B 场景:看小小明有哪些朋友还没有录入兴趣爱好,允许小明把自己的兴趣爱好推荐给他们。
  1. match (n:Person) where id(n)='p933'
  2. match (n)-[r]->(m) where not (m)-[:HAS_INTEREST]-() return id(m)
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将子查询作为中间结果

此外,还可以将子查询作为中间结果,朋友推荐场景下,cypher 语句还可以这么写:
  1. match (n) where id(n)='p367'
  2. with [(n)-[:KNOWS*2..2]->(b)|id(b)] as hop2, [(n)-[:KNOWS]->(b)|id(b)] as hop1
  3. return [x in hop2 where not x in hop1|x] limit 10
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在这条查询语句中,Graph Pattern 出现在了 with 子句中,用于收集某个点的多跳结果。
另外采用类似的写法还可以筛选三度好友中 “我不认识的人” 的数目,示例如下:
  1. match (n) where id(n)='p367'
  2. with [(n)-[:KNOWS*3..3]->(b)|id(b)] as hop3, [(n)-[:KNOWS*1..2]->(b)|id(b)] as hop2
  3. return size([x in hop3 where not x in hop2|x])
  4. cypher_result = ges_util.cypher_query("""
  5. match (n) where id(n)='p367'
  6. with [(n)-[:KNOWS*3..3]->(b)|id(b)] as hop3,  [(n)-[:KNOWS*1..2]->(b)|id(b)] as hop2
  7. return size([x in hop3 where not x in hop2|x])""",formats=['row','graph']);
  8. ges_util.format_cypher_result(cypher_result, boxHeight=200)
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同时这种子查询也可以包含子查询过滤条件,进行各类统计操作,如上述提到的潜在二度人脉分析:
  1. match (n:Person) where id(n) in ['p367','p13194139534836','p932','p4398046512206','p6597069767359']
  2. with n, [(n)-[:KNOWS*2..2]->(m) where not (n)-->(m)|m] as recSet
  3. return id(n) as key,
  4. size([x in recSet where x.gender='male']) as maleNumber,
  5. size([x in recSet where x.gender='female']) as femaleNumber
  6. cypher_result = ges_util.cypher_query("""
  7. match (n:Person) where id(n) in ['p367','p13194139534836','p932','p4398046512206','p6597069767359']
  8. with n, [(n)-[:KNOWS*2..2]->(m) where not (n)-->(m)|m] as recSet
  9. return id(n), size([x in recSet where x.gender='male']),size([x in recSet where x.gender='female'])
  10. """,formats=['row','graph']);
  11. ges_util.format_cypher_result(cypher_result, boxHeight=200)
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下列元素出现在 with 子句中,描述了一个子查询:
  1. [(n)-[:KNOWS*2..2]->(m) where some-condition|m] as recSet
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这里会对每个遍历到的 n,都进行二跳查询, 取二跳查询的末端节点 m,然后组装成一个列表。
注意到 where 条件中,使用了刚刚提到的条件子查询:
  1. where not (n)-->(m)
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这里条件使用 where 条件,对子查询的结果进行了过滤,且过滤时,是将一个 Graph Pattern 作为的过滤条件,最后使用竖线进行投影。
在 return 子句中,使用了 Cypher 中 List Comprehension 的语法,进行列表过滤,并获取大小:
  1. return id(n) as key,
  2. size([x in recSet where x.gender='male']) as maleNumber,
  3. size([x in recSet where x.gender='female']) as femaleNumber
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支撑子查询作为过滤条件的,是 RollUpApply 算子,可以通过 explain 看到其在查询计划中发挥价值:
  1. cypher_result = ges_util.cypher_query("""explain
  2. match (n:Person) where id(n) in ['p367','p13194139534836','p932','p4398046512206','p6597069767359']
  3. return n, [(n)-[:KNOWS*2..2]->(m) where not (n)-->(m)|m] as recSet""",formats=['row','graph']);
  4. ges_util.format_cypher_result(cypher_result, boxHeight=200)
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对每个左子树生成的结果(这里是 (n:Person))都会作为变量输入,并执行右子树,将右子树的结果打包返回为 list。
此外还可以限制子查询的数目,对查询进行 PerNodeLimit(单点跳出限制:每个点每层只能向外跳出限定个数的顶点)。
例如兴趣推荐 A 场景中,看看小明的朋友有哪些兴趣爱好(人 - INTEREST - 兴趣),从每个朋友的兴趣爱好中选取至多 N 个兴趣爱好推荐给小明。
  1. match (n:Person) where id(n)='p367'
  2. match (n)-[r]->(m)
  3. return [(m)-[:HAS_INTEREST]-(a)|a][0..3]
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为了可视化演示效果,可视化时同步打印了 “朋友” 和 “INTEREST” 边。
同样的,也可以使用 RollUpApply+Limit 对每跳做 PerNodeLimit,例如统计和小明的朋友有共同兴趣爱好的朋友,每跳最多找 3 个点,最后一跳每个点最多找 1 个点:
  1. match (n:Person) where id(n)='p367'
  2. match (n)-[r]->(m) with m limit 3
  3. with m,[(m)<-[r1:HAS_INTEREST]-(a)|a][0..3] as interests
  4. unwind interests as interest
  5. with interest, [(interest)-[r1:HAS_INTEREST]->(a) where not (a)--(m)|[r1,a]][0..1] as soulMate
  6. return *
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其他子查询

使用 with 也可以实现其他子查询任务,例如上一跳的查询结果经过 limit 限制后输入下一跳,成为查询条件:
  1. match (n:Person) where id(n) in ['p367','p13194139534836','p932','p4398046512206','p6597069767359']
  2. with n limit 10
  3. match (m:Person{lastName:n.lastName}) return n.lastName, m.firstName
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使用 explain 也可以看到其查询计划:
  1. cypher_result = ges_util.cypher_query("""explain match (n:Person) where id(n) in ['p367','p13194139534836','p932','p4398046512206','p6597069767359']
  2. with n limit 10
  3. match (m:Person{lastName:n.lastName}) return n.lastName, m.firstName""",formats=['row','graph']);ges_util.format_cypher_result(cypher_result)
复制代码
 
由于不同的 n,其 n.lastName 的值是不固定的,所以需要针对每个 n,去做 match (m:Person {lastName:n.lastName}) 这样的查询,因此需要使用 Apply 子查询算子支撑这样的语句。
总结

借助子查询局部遍历是图查询中的常用操作,将子查询作为条件过滤或者中间结果,可以满足某些业务场景下的对查询的局部有限制的诉求,如文中提到的社交网络分析,再如股权穿透网络中穿透层数分析、装备制造和配置管理(IT 设备管理)领域依赖识别和变更影响分析等。
此外,由于 Cypher 以行的形式组织数据,某些情况下使用子查询可以节省中间结果产生,加速 Cypher 查询的执行。
当然,使用更高效的 API(如 GES 产品中有多跳过滤 API) 或者使用非行存的查询执行引擎也是可选的解决方案。
 
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