医学图像分割常用的评价指标

火影  金牌会员 | 2022-6-24 21:57:01 | 显示全部楼层 | 阅读模式
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医学图像分割常用的评价指标



    在医学图像分割的论文中,常常看到Dice、VOE、RVD、MSD等指标,但是具体这些指标是什么意思呢,我们进行相应的简单说明。
                                        V                                   s                            e                            g                                           \text V_{s e g}               Vseg​:代表预测的分割结果
                                        V                                   g                            t                                           \text V_{g t}               Vgt​:代表ground truth的分割结果
1、Dice(Dice similarity coefficient)

    Dice 系数是一种评估相似度的函数,通常用于计算两个样本的相似度或者重叠度,在三维医疗图像分割应用也比较多,具体如下:
                                     Dice                          =                         2                                                          V                                               s                                     e                                     g                                                      ∩                                           V                                               g                                     t                                                                                    V                                               s                                     e                                     g                                                      +                                           V                                               g                                     t                                                                         \text { Dice }=2 \frac{V_{s e g} \cap V_{g t}}{V_{s e g}+V_{g t}}                    Dice =2Vseg​+Vgt​Vseg​∩Vgt​​
2、IoU(Intersection over Union)

    IoU是应用非常多的度量指标,当然除了分割任务,在目标检测中应用也是非常多的。具体如下:
                                    I                         o                         U                         =                                                          V                                  seg                                           ∩                                           V                                               g                                     t                                                                                    V                                  seg                                           ∪                                           V                                  gt                                                        =                                                          V                                  seg                                           ∩                                           V                                               g                                     t                                                                                    V                                  seg                                           +                                           V                                               g                                     t                                                      −                                           (                                               V                                     seg                                               ∩                                               V                                                   g                                        t                                                           )                                                             IoU=\frac{V_{\text {seg }} \cap V_{g t}}{V_{\text {seg }} \cup V_{\text {gt }}}=\frac{V_{\text {seg }} \cap V_{g t}}{V_{\text {seg }}+V_{g t}-\left(V_{\text {seg }} \cap V_{g t}\right)}                   IoU=Vseg ​∪Vgt ​Vseg ​∩Vgt​​=Vseg ​+Vgt​−(Vseg ​∩Vgt​)Vseg ​∩Vgt​​
    当然了,在医学图像分割的文章中,这个参数出现的并不多,而且他还会被另一个名称代替,即Jaccard。这两个是完全相同的参数。
3、VOE(Volumetric Overlap Error)

    VOE可以称之为体积重叠误差,代表的是错误率。具体如下所示:
                                    V                         O                         E                         =                         1                         −                                                          V                                               s                                     e                                     g                                                      ∩                                           V                                               g                                     t                                                                                    V                                               s                                     e                                     g                                                      ∪                                           V                                               g                                     t                                                                         V O E=1-\frac{V_{s e g} \cap V_{g t}}{V_{s e g} \cup V_{g t}}                   VOE=1−Vseg​∪Vgt​Vseg​∩Vgt​​
    大家可以仔细观察VOEIoU的计算公式。在大多数医学分割的论文中,其实很多都用VOE代替IoU了。这两个参数本质上都是一样的,只计算一个就可以了,但是医学领域对错误率更加敏感。
4、RVD(Relative Volume Difference)

    RVD表示两者体积之间的差异,数学定义如下:
                                    R                         V                         D                         =                                   (                                                   V                                               s                                     e                                     g                                                                  V                                               g                                     t                                                             −                            1                            )                                  ∗                         100                         %                               R V D=\left(\frac{V_{s e g}}{V_{g t}}-1\right) * 100 \%                   RVD=(Vgt​Vseg​​−1)∗100%
5、 MSD(Maximum Symmetric Surface Distance)

    MSD也称为MSSD,评估的是两样本之间的对称距离,MSD的值越低则代表两个样本之间的匹配度越高。
                                    M                         S                         D                         =                                   (                                                   max                                  ⁡                                                      i                                  ∈                                  s                                  e                                  g                                                            (                                                        min                                     ⁡                                                           j                                     ∈                                     g                                     t                                                      (                               d                               (                               i                               ,                               j                               )                               )                               )                                      ,                                                   max                                  ⁡                                                      j                                  ∈                                  g                                  t                                                            (                                                        min                                     ⁡                                                           i                                     ∈                                     s                                     e                                     g                                                      (                               d                               (                               i                               ,                               j                               )                               )                               )                                      )                                        MSD=\left(\max _{i \in s e g}\left(\min _{j \in g t}(d(i, j))\right), \max _{j \in g t}\left(\min _{i \in s e g}(d(i, j))\right)\right)                   MSD=(i∈segmax​(j∈gtmin​(d(i,j))),j∈gtmax​(i∈segmin​(d(i,j))))
    对于这个参数,了解的并不是很多,包括对称位置平均表面距离(average symmetric surface distance,ASSD)等,感觉主要是用在三维图像分割中。本人做二维图像分割较多,主要使用Dice、VOE、RVD

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