Shell脚本基础知识-开端版

本文是笔者研究生期间在阅读《Linux命令行与shell脚本编程大全》之后总结出来的一些重点知识的记载，在此重新整理输出。以便在给上个帖子 涉及到的相干知识点进行一下讲解，帮助本身复习

shell脚本的首行规范化应该是

1. #!/bin/bash  
2. # function description

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其中第一行必须如此，#后面的惊叹号会告诉shell用哪个shell来运行脚本，第二行是本脚本的功能分析。
一. 引用变量与数组

● 当进行变量赋值后，要引用这个变量，则要用 $符号，而如果要某个命令的结果进行赋值则要用 $()
● 变量名称区分大小写，赋值的=前后不能有空格

1. days=10
2. guest="Katie"
3. echo "$guest checked in $days days ago"
5. #!/bin/bash
6. testing=$(date)
7. echo "The date and time are: " $testing

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●  一维数组，即向量，空格隔开，下标读取， */@读取所有元素

1. array_name=（value0 value2 value3）
2. # 数组使用
3. my_array=(A B C D)
4. echo "数组的元素为: ${my_array[*]}
5. echo "数组的元素为: ${my_array[@]}
6. echo "数组的元素个数为： ${#my_array[@]}"

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● 重定向输入输出

1. #### 输出重定向
2. > # 保存
4. >> # 追加保存，不覆盖
6. #### 输入重定向，也就是将 file 作为参数 发给这个命令，比如下面，
7. # wc命令可以对对数据中的文本进行计数
8. wc < file1

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● 管道 |  ：一个命令的输出作为另一个命令的输入
rpm -qa | sort > rpm.list
● 其他

1. # 命令替换
2. for i in `seq 1 10`
3. `expr 2+2`
5. #### echo read printf test命令
6. echo "It is a test"
7. echo ""It is a test"" # 转义
9. #！/bin/sh
10. read name # 从标准输入中读取参数赋给name变量
11. echo "$name It is a test"
12. echo -e "OK! \n"  # -e 开启转义
13. echo "It is a dog" > myfile
15. printf "%-10s %-8s %-4s.2f\n" 郭靖 男 66.1234

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二. 流程控制

2.1 for循环

1. ## for循环
2. for loop in `seq 1 5` # 命令替换
3. do
4.   echo "The value is: $loop"
5. done
7. #或者一条命令
8. for var in item1 item2 item3;do echo $var;done
10. # while循环
11. while condition
12. do
13.   command
14. done
16. #### 示例小脚本
17. for i in (seq 1 22) X Y M;do cat chr{i}.fa >>hg38.fa;done # () 都是做命令替换的 {}是做变量替换的
18. for i in `seq 1 12`;do cut -f 6,9 w${i}_transcript.gtfs >w${i}.txt;done
19. for i in `seq 1 12`;do sort w${i}.txt >w${i}.gtf;done
20. for i in `cat list.txt`;do grep -w $i whole.gff3|awk '$3=="gene"' >>result.txt;done

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2.2 if-else类

1. ### shell流程控制
2. # 判断 只有第一个 command正常成功执行，返回退出码0的语句中的then的 command2才会被执行
3. if command1
4. then
5.           command2
6.     command3
7. fi
9. # 另一种形式
10. if command; then
11.   commands
12. fi
14. # if-then-else 语句
15. if command
16. then
17.    command2
18. else
19.    command3
20. fi
22. # 嵌套if
23. if grep $testuser /etc/passwd
24. then
25.    echo "The user $testuser exists on this system."
26. else
27.    echo "The user $testuser does not exist on this system."
28.    if ls -d /home/$testuser/
29.    then
30.       echo "However, $testuser has a directory."
31.    fi
32. fi
35. # elif
36. if command1
37. then
38.    commands
39. elif command2
40. then
41.     more commands
42. fi

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2.3 if中对条件的判断
除了 正常执行某个命令之外，还可以用 test  和  [ condation ]  两种形式来判断，判断条件有数值比较 字符串比较 文件比较

1. ### 更一般性的判断语句，而不只是以command是否成功执行为判断依据
2. # test condition # 检查某个表达式是否成立；test可以判断 数值比较 字符串比较 文件比较
3. if test conditon #
4. then
5. fi
7. if [ condition ] # 另一种方式
8. then
9. fi

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●  数值比较  左边 对于右边的关系
-eq        相等
-ge        大于或等于
-gt         大于
-le        小于或等于
-lt        小于
-ne         不等于
● 字符串比较
-n        长度非0
-z        长度为0
=        相同
!=        不同
>        大
<        小
test比较数值用 文本代码(eq,lt)来比较，而比较字符串用 尺度数学符号(>=)来比较，比较字符串使用尺度的ASCII码次序，数值< 大写字母< 小写字母

1. # 节选自 《linux命令行与shell脚本大全》第三版 P245
2. # -n -z 检查一个变量是否含有数据 可以用来判断 自己写的shell程序的命令行参数是否完备
3. cat test10.sh
4. $ cat test10.sh
5. #!/bin/bash
6. # testing string length
7. val1=testing
8. val2=''
9. #
10. if [ -n $val1 ]
11. then
12.         echo "The string '$val1' is not empty"
13. else
14.         echo "The string '$val1' is empty"
15. fi
16. #
17. if [ -z $val2 ]
18. then
19.         echo "The string '$val2' is empty"
20. else
21.         echo "The string '$val2' is not empty"
22. fi
23. #
24. if [ -z $val3 ]
25. then
26.         echo "The string '$val3' is empty"
27. else
28.         echo "The string '$val3' is not empty"
29. fi
30. $
31. $ ./test10.sh
32. The string 'testing' is not empty
33. The string '' is empty
34. The string '' is empty
35. $

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●  文件比较
-d file          查抄file是否存在并是一个目录
-e file         查抄file是否存在
-f file         查抄file是否存在并是一个文件
file1 -nt file2         查抄file1是否比file2新
file1 -ot file2         查抄file1是否比file2旧
更多参见 P246 12.4.3
● 复合条件测试
[ condtion1 ] && [ condtion2 ]
[ condtion1 ] || [ condtion2 ]
2.4 Case

1. # case
2. case variable in
3. pattern1 | pattern2) commands1;;
4. pattern3) commands2;;
5. *) default commands;;
6. esac

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例子

1. case $USER in
2. rich | barbara)
3. echo "Welcome, $USER"
4. echo "Please enjoy your visit";;
5. testing)
6. echo "Special testing account";;
7. jessica)
8. echo "Do not forget to log off when you're done";;
9. *)
10. echo "Sorry, you are not allowed here";;
11. esac

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三.处置惩罚命令行输入参数

在命令行获取参数，默认的 执行脚本被以为是 $0，那么 后面每隔一个空格 的参数就依次是 $1, $2  ......。

1. # 1.命令行参数  位置参数  parameters
2. (basename $0)， $1 ~ $9   ${10} (参数检测 -n -z )
3. # 2.特殊参数变量
4. $# : 命令行参数总和  最后一个参数 ${!#}         $* $@ 所有的参数
5. # 3.移动变量
6. shift n
7. ## 4.处理选项options -a  getopt/getopts
8. case  --双破折线  区分 parameter -- option   -a num1 -c num2
9. # getopt / getopts 格式化命令行或参数  P300
10. getopt ab:cd -a -b test1 -c -d test2 test3
11. # 5. 选项标准化 默认的选项表示的意思  
12. -c 计数 -r 递归 -q 安静
13. ### 6.获得用户输入
14. echo -n "Enter your name: " # 用户输入与提示文字 在一行，类似表单
15. read name # read 将输入结果放进一个变量中
16. echo "Hello $name, welcome to my program. "
17. # 或者 一行搞定
18. read -p "Please enter your age: " age
19. # 超时 -t
20. if read -t 5 -p "Please enter your name: " name
21. then
22.         echo "Hello $name, welcome to my script"
23. else
24.         echo
25.         echo "Sorry, too slow! "
26. fi
27. # -s 隐藏读取 比如密码  实际上，数据会被显示，只是 read命令会将文本颜色设成跟背景色一样
28. read -s -p "Enter your password: " pass
30. ## 从文件读取 实用
31. count=1
32. cat test | while read line
33. do
34.         echo "Line $count: $line"
35.         count=$[ $count + 1]
36. done
37. echo "Finished processing the file"

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四.重定向深入理解

1. ### 1.输入与输出
2. #文件描述符 非负整数 0标准输入 1标准输出 2标准错误
3. <  >  2>  1>  &>
4. ### 2.脚本重定向
5. ## 临时重定向
6. cat test8
7. #!/bin/bash
8. # testing STDERR messages
9. echo "This is an error" >&2
10. echo "This is normal output"
11. $
12. $./test8 2>test9 # 错误的信息被重定向
13. ## 永久重定向
14. $ cat test10
15. #!/bin/bash
16. # redirecting all output to a file
17. exec 1>testout # or exec 2>testerror
18. echo "This is a test of redirecting all output"
19. echo "from a script to another file."
20. echo "without having to redirect every individual line"
21. ### 3.重定向输入
22. exec 0< testfile
23. while read line

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BTW:
阅读完上面的内容，根本上就能看懂上期我发的 简单可靠的SpringBoot Jar包启动脚本了。

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