基于知识图谱的医疗问答系统（Kubernetes）

目录

• 一、条件预备
  
  
  
  • 1、创建neo4j用户，数据目录
    
  • 2、修改 neo4j.conf 配置文件
    
  
  
• 二、k8s 集群摆设
  
  
  
  • 1、步骤文档
    
  • 2、选择 k8s-master1 节点打标，kube-scheduler 直接将 pod 调度到该节点
    
  • 3、创建 neo4j 命名空间
    
  • 4、创建pv
    
  • 5、创建pvc
    
  • 6、创建 neo4j 的Deployment
    
  • 7、创建 NodePort 范例的 svc (实测本地可以正常运行neo4j但是欣赏器无法连接)
    
  • 8、使用 LoadBalancer 范例的 svc 服务
    
    
    
    • 8.1、技术选型：METAILB
      
    • 8.2、创建 MetalLB 命名空间
      
    • 8.3、下载 MetalLB 的安装文件
      
    • 8.4、查看 MetalLB 需要的镜像
      
    • 8.5、修改 metallb.yaml 文件
      
    • 8.6、所有节点提前下载 speaker 和 controller 镜像
      
    • 8.7、安装 MetalLB
      
    • 8.8、查看 pod 验证摆设情况
      
    • 8.9、配置地址池
      
    • 8.10、创建地址池
      
    • 8.11、创建 LoadBalancer 范例的 SVC
      
    • 8.12、应用 svc
      
    • 8.13、验证 svc 状态
      
    
    
  
  
• 三、测试连接
  
• 四、Neo4j 初始配置
  
  
  
  • 1、清空 Neo4j 数据库
    
  
  
• 五、PyCharm 项目安装必备库
  
  
  
  • 1、py2neo 库
    
  • 2、pymongo 库
    
  • 3、lxml 库
    
  
  
• 六、python 连接 Neo4j
  
  
  
  • 1、欣赏器 browser 查看Neo4j 连接状态
    
  • 2、修改源文件中 Graph 连接格式
    
  
  
• 七、PyCharm 导入医疗知识图谱
  
  
  
  • 1、读取文件
    
  • 2、建立节点
    
  • 3、创建知识图谱中心疾病的节点
    
  • 4、创建知识图谱实体节点范例schema
    
  • 5、创建实体关系边
    
  • 6、创建实体关联边
    
  • 7、导出数据
    
  • 8、程序主入口
    
    
    
    • 8.1、UnicodeDecodeError: 'gbk' codec can't decode byte 0xaf in position 81: illegal multibyte sequence
      
    • 8.2、修改代码：for data in open(self.data_path):
      
    
    
  • 9、运行结果
    
  • 10、优化导入数据时间
    
  
  
• 八、PyCharm 实现问答系统
  
  
  
  • 1、问句范例分类脚本
    
  • 2、问句分析脚本
    
  • 3、问答程序脚本
    
  • 4、问答系统实现
    
    
    
    • 4.1、模型初始化
      
    • 4.2、问答主函数
      
    • 4.3、运行主入口
      
    • 4.4、运行结果
      
    
    
  
  

一、条件预备

1、创建neo4j用户，数据目录

1. useradd neo4j
2. mkdir -pv /mnt/neo4j/{logs,data,conf,import}
3. chown -R neo4j:neo4j /mnt/neo4j/logs
4. chown -R neo4j:neo4j /mnt/neo4j/data
5. chmod -R 755 /mnt/neo4j/logs
6. chmod -R 755 /mnt/neo4j/data

复制代码

• data——数据存放的文件夹
  
• logs——运行的日志文件夹
  
• conf——数据库配置文件夹（在配置文件neo4j.conf中配置包括开放远程连接、设置默认激活的数据库）
  
• import——为了大批量导入csv来构建数据库，需要导入的节点文件nodes.csv和关系文件rel.csv需要放到这个文件夹下）
  

2、修改 neo4j.conf 配置文件

[code]cat > /mnt/neo4j/conf/neo4j.conf > /etc/hosts        echo "已将 '$node' 添加到 /etc/hosts 文件中。"    fidone# 验证用户输入的主机名与对应的 IP 地址是否存在于本地的 /etc/hosts 文件中ip_address=${hosts[$hostname]}host_line="${ip_address} ${hostname}"if grep -q "$host_line" /etc/hosts; then    echo "主机名 '$hostname' 与对应的 IP 地址 '$ip_address' 已经存在于本地的 /etc/hosts 文件中。"else    echo "主机名 '$hostname' 与对应的 IP 地址 '$ip_address' 未能在本地的 /etc/hosts 文件中找到，请检查。"fi# 设置 sysctl 参数echo "设置 sysctl 参数..."cat > /etc/sysctl.d/k8s.conf  /etc/docker/daemon.json