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生信初学者教程(十四):差异效果的火山图 ...
生信初学者教程(十四):差异效果的火山图
花瓣小跑
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2024-9-28 08:39:49
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先容
火山图(Volcano Plot)是一种用于展示基因差异表达分析效果的二维散点图。它通过同时展示统计显著性和变化幅度,帮助研究者识别出在不同条件下显著差异表达的基因。火山图的横轴通常表示基因表达变化的倍数对数(log2 fold change),纵轴表示统计显著性的负对数值(-log10 p-value)。这种图表因其外形类似火山而得名。
火山图的构成息争读:
横轴(X轴):通常表示基因表达的变化倍数对数(log2 fold change)。数值越大,表示基因表达差异越大。正值表示上调表达,负值表示下调表达。比方,log2 fold change = 1 表示基因表达增长了两倍,而 log2 fold change = -1 表示基因表达减少了一半。
纵轴(Y轴):表示统计显著性的负对数值(-log10 p-value)。数值越大,表示基因表达变化的显著性越高。比方,假如 p-value = 0.01
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