医疗 MLLM 框架编程实现
本医疗 MLLM 框架联合 Python 与 PyQt6 构建,旨在实现多模态医疗数据融合分析并提供可视化界面。下面从数据预处理、模子构建与训练、可视化界面开辟、模子 - 界面通讯与摆设这几个关键部门具体介绍编程实现。
6.1 数据预处理
在医疗 MLLM 框架中,多模态数据的预处理黑白常关键的一步,它直接影响到后续模子的训练效果和性能。我们需要对医学影像、文本数据和音频数据分别进行预处理,以确保数据的质量和一致性。
6.1.1 医学影像预处理
医学影像数据通常包罗噪声、不同的对比度和分辨率等问题,因此需要进行去噪、归一化和裁剪等利用,并将其转换为恰当模子输入的张量格式。使用 OpenCV 和pydicom库可以方便地完成这些任务。示例代码如下:
- import cv2
- import pydicom
- import torch
- import numpy as np
- def preprocess_image(image_path):
- ds = pydicom.dcmread(image_path)
- image = ds.pixel_array
- # 去噪
- image = cv2.fastNlMeansDenoisingColored(image, None, 10, 10, 7, 21)
- # 归一化
- image = image / np.max(image)
- # 裁剪(假设裁剪为224x224)
- h, w = image.shape[:2]
- if h > 224 or w > 224:
- start_h = (h - 224) // 2 if h > 224 else 0
- start_w = (w - 224) // 2 if w > 224 else 0
- image = image[start_h:start_h + 224, start_w:start_w + 224]
- # 转换为张量
- image = torch.from_numpy(image).unsqueeze(0).float()
- return image
复制代码 6.1.2 文本数据预处理
文本数据通常包罗大量的天然语言信息,需要进行分词、定名实体识别(NER)等利用,并联合医疗术语库统一表述,以便模子更好地理解和处理。借助spaCy库可以完成这些任务。示例代码如下:
- import spacy
- from spacy.matcher import Matcher
- nlp = spacy.load('en_core_web_sm')
- matcher = Matcher(nlp.vocab)
- # 假设医疗术语库为一个列表
- medical_terms = ['diabetes', 'pneumonia']
- for term in medical_terms:
- pattern = [{"LOWER": term}]
- matcher.add(term, [pattern])
- def preprocess_text(text):
- doc = nlp(text)
- new_text = []
- for match_id, start, end in matcher(doc):
- span = doc[start:end]
- new_text.append(span.text)
- new_text = " ".join(new_text)
- return new_text
复制代码 6.1.3 音频数据预处理
音频数据可以通过提取特性来表现,其中梅尔频率倒谱系数(MFCC)是一种常用的特性。通过librosa库可以方便地提取 MFCC 特性,并与文本转录对齐(此处简单示例不涉及实际对齐逻辑)。示例代码如下:
- import librosa
- def preprocess_audio(audio_path, n_mfcc=13):
- audio, sr = librosa.load(audio_path)
- mfccs = librosa.feature.mfcc(y=audio, sr=sr, n_mfcc=n_mfcc)
- return mfccs
复制代码 6.2 模子构建与训练
模子的构建和训练是医疗 MLLM 框架的核心部门,我们采用 Q - Former 架构作为核心,联合 Transformer 的多模态融合能力来构建模子,并对其进行训练。
6.2.1 模子构建
基于transformers库构建模子,采用 Q - Former 架构,联合 Transformer 的多模态融合能力。示例代码如下:
- import torch
- from transformers import QFormerModel, QFormerConfig
- class MedicalMLLM(torch.nn.Module):
- def __init__(self):
- super().__init__()
- self.config = QFormerConfig(vision_width=76
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